מחסום אייל מיועד להולכי רגל ולפלסטינים בלבד. זהו המחסום העיקרי למעבר פועלים ממרכז הגדה. פועלים בעלי אישור כניסה לעבודה בישראל. יכולים לעבור בו לצורכי מסחר, רפואה ולביקור אסירים.
המחסום נבנה על הקו הירוק צפונית מקלקיליה במכשול ההפרדה העוטף את העיר.
המחסום התחיל לפעול בשנת 2004  בידי הצבא. מועדי הפתיחה בימי חול מ-04:00 עד 19:00. התחלנו לקיים שם משמרות ב-2007. הגענו למחסום לפני פתיחתו ב-4 בבוקר. דיווחנו על התנאים הקשים והתורים הארוכים והדחוקים של פועלים, שצריכים להמשיך את דרכם בהסעות לעבודה ברחבי ישראל.
בסוף יוני 2009 המחסום עבר להפעלה בידי חברת אבטחה אזרחית,
זמן המעבר התקצר בהדרגה, היום הוא מהיר יותר, אולם הפלסטינים עדיין צריכים להגיע בשעה מאד מוקדמת כדי להספיק להסעות. היום עוברים כ 15000 איש.